控制角色：原始蜘蛛侠

敌人物种开始出现变化，先把屋子里面的敌人都干掉获得钥匙。在房间尽头看到Eddie已经被完全控制并且放出炸弹。跟上去进入控制室打开机关后电子门会有时间限制，在时间消耗之前进入门内。

满屋子的红色激光爬墙通过再次遭遇变异怪Eddie，看来劝说已经不管用了，继续追击时发生爆炸导致2099发生改变。

快速逃离爆炸区域，看到巨型气罐后按动开关，但是2099那边仍然还有两个气罐在泄漏，需要找到另外两个气罐并且实施保护。最后需要关闭铁门才能保护最后一个气罐。

攻击铁门打开缺口进入通风管道，来到控制台拉动开关后跟随紫色球体的线路爬墙，这个门同样有时间限制的。从怪物守卫身上获得钥匙后打开铁门进入研究室内，看到Eddie和博士在一起，一切都有了合理的解释，而且Eddie变身后能力更加强大。

Boss战开始，虽然看起来有些凶悍但是并没有那么可怕，近/远距离连击配合L2完全没有威胁，被打到空中的话跳跃攻击正好可以施展。第一阶段把Boss扔进仓库后走进去象征性的战斗后会进入剧情。