终于把三巨头给送回老家，但事情还没有完全结束，接下来就是揪出幕后首脑的时间，先前受Rico帮助反抗的三个阵营，这时就必须回报他来结束这一切。动画结束后，玩家可以在这三个阵营里选择一个来帮助自己，只要找架直升机飞到雷达标示的阵营总部里即可。值得一提的是，选择任何一个阵营都不会影响游戏的发展，只有带的小兵颜色不同而已。

与反抗军一起来到了一座热带岛屿，只要朝着雷达所标示的方向前进，便能接收到下一个任务的指示。但是在过程中，会有非常多的敌人前来攻击玩家，建议在黑市里把补足身上的弹药后，再开始这项任务。如果玩家已经可以购买Machine Gun，记得也把它给带在身上，任务后期它会助你一臂之力。

一路过关斩将来到基地的内部，任务会更新为：「Destroy the First AA-gun」，只要依照雷达所指示的地点破坏目标便能完成任务。不过笔者特别要提醒玩家的是，最好慢慢清光所有敌人后再进行破坏，因为每个炮台堡垒都会有一座重机枪来扫射玩家，太掉以轻心只会让任务失败。

接着搭乘一旁的缆车到达下一个破坏的地点，到达另一端时别急着往前冲，因为缆车站外已经有大批敌人等着玩家。利用缆车当做掩体，慢慢地光所有敌人后再前进到目的地，就能避免一出站就被扫死的命运。摧毁掉第二个重要设施后，第三个目标就在右侧不远的地方，只要使用堡垒里的重机枪往目标扫射，就可以直接把目标给摧毁掉。