游戏采用会自动依照状况改变动作的战斗系统，以此就算同样是输入攻击或闪躲，实际的动作都会依照战况而改变。每次系统会固定锁定一名敌人，这部分无法手动切换，但会随着位置与方向的变话而改变。因为拳脚攻击只会针对锁定的敌人，所以不适合在地面上与众多敌人缠斗，一般的战法多半是先用上勾拳将敌人击飞到空中，接着继续按 ☐ 钮自动跳上空中进行追击，此时就不至于被地面上的敌人围殴，只需要小心持枪敌人的攻击即可，就算在空中还是可以按 ◯ 钮回避。

　　当蜘蛛人即将被敌人攻击到时，头上会冒出警觉的效果代表蜘蛛异能的感应，提醒玩家留意。即使画面上看不到发动敌人的攻击还是能感应到。此时只要从容按下回避钮即可自动闪开。

　　以蛛丝来牵制敌人是蜘蛛人的代表性招式：

　　整个战斗的流程相当顺畅爽快，玩家不需要烦恼像是锁定敌人、回避方向之类的细节，只要在适当的时机输入适当的指令，就能施展出华丽的招式。不过一开始还是需要一些时间熟悉操作。

　　在解决阻挡去路的歹徒后，蜘蛛人赶往费斯克大楼协助攻坚。因为正常通道都被封闭，没办法搭电梯上楼，有时候就必须借由通风管来移动，楼层间则是经常会需要靠 L2 + R2 钮定点移动。

　　突破重重险阻后，蜘蛛人终于来到金霸王的办公室，展开第一场头目战。虽然金霸王外表看来只是个脑满肠肥的胖子，不过他其实有着不亚于蜘蛛人的强悍肉体与过人怪力，正面猛攻连蜘蛛人都挨不住，直接攻击他也无法奏效，因此必须采用迂回的手段，像是透过蛛网连射来暂时困住他，再以蜘蛛重击与拳脚攻击来消耗他的体力。或是以环境物件砸他，让他暂时昏厥再进行攻击。

　　当金霸王的体力消耗到一定程度后，就会进入电影般的动作场面演出，此时会透过 QTE 即时反应按钮输入的方式来决定双方交手的结果，就“出色”难度来说，输入的条件并不算严苛。

　　顺利解决大型任务之后，即可获得大量的经验值提升等级。升级后除了基本能力的强化之外，还能获得技能点数，可以用来解锁 3 大体系的技能，分别为强化蛛丝攻防招式的“创新者”、强化拳脚攻击招式的“捍卫者”以及强化蛛丝摆荡移动能力的“蛛丝射手”。战衣与蜘蛛装置则是需要解开特定事件任务后，收集足够的素材与资源才能打造，后续还可以进一步强化与更换技能。

　　科学研究者彼得‧帕克的日常

　　在浅尝过蜘蛛人的蛛丝摆荡与战斗后，游戏随即将玩家导回彼得‧帕克的身分，应老师的召唤回到实验室协助老师应对赞助者的考察。此时玩家将体验以普通人彼得的模式来操作的任务，主要是在实验室里进行各种益智解谜的挑战，像是置放电路元件来导通电流、控制电压，排除机器装置的故障，分析质谱仪的光谱来发现新材料等。这部分后续也会成为彼得研发蜘蛛装置的关键。

　　开放世界必备的 “爬塔”

　　在玩家初次体验过彼得‧帕克的常人生活后，游戏马上又回到蜘蛛人的不平凡生活。这次他应渡边尤里的请求来到纽约市警署，原来是警署耗费巨资由奥斯朋公司建置的犯罪监视系统被入侵而全面瘫痪，由里希望蜘蛛人协助找出问题与修复故障。这段剧情其实是要带出开放世界游戏必备的 “爬塔” 要素。在《漫威蜘蛛人》里，这个犯罪监视系统的电波塔台就是开启地图资讯必备的塔。每区都有 3 个塔，全数修复后才能开启该区的地图。修复的方法为透过地图找到塔台，以左右类比摇杆转圈来控制电波的频率与震幅，顺利同步之后就能修复，取得地图上的犯罪与物件资讯。

　　随着塔台的修复，蜘蛛人将能发现更多犯罪事件，玩家可以自己决定是否要处理这些支线。

　　关于收集要素的部分，当开启塔台之后，蜘蛛人就可以寻找长年以来散落在市内各地的背包，取得背包后就可以获得背包代币，这是用来制造新战衣或新蜘蛛装置所不可或缺的重要资源。

　　此外，游戏中还准备了拍照要素，完成拍摄指定地标的任务一样可以获得经验值与代币。

　　后续还会开放蜘蛛人自拍的功能：

　　后续由里又告诉蜘蛛人，金霸王在市内许多地方都有可疑的 “工地”，希望蜘蛛人前往调查。这些工地其实就是金霸王用来掩盖犯罪活动的巢穴，整个市内有许多这样的点，玩家可以自由决定何时要前往解决这些任务。顺利清除这些工地犯罪巢穴的话，就可以获得丰厚的经验值等报酬。

　　战斗时可以利用环境来克敌：