3DS版的《生化危机：雇佣军3D》是将自从《生化危机3》开始出现在游戏中的一个游戏模式独立出来做成单独发售游戏的作品。首次在3DS平台上发售的本作将延续《生化危机5》佣兵模式的设定，游戏的规则就是玩家在规定的时间内击败大量涌现的敌人。因为3DS内建无线模块，所以《生化危机：雇佣军3D》支持通过无线网络进行二人联机作战。因为强调纯粹的游戏体验，在这款游戏中没有任何故事要素。 　　CAPCOM的制作人员对本作的操作进行了优化，使其更容易操作并能适合更多的玩家。得以与3DS下方的触摸屏，本作中也加入了一些触摸操作的要素。相比以往佣兵模式，本作在系统上最大的变化就是加入了第一人称视角的射击功能。普通状态下游戏采用的是第三人称越肩视角，当玩家举起武器攻击时，游戏会自动切换到第一人称视角，此时可以用摇杆进行精准的射击。另外，在第一人称视角瞄准状态下，可以自由的移动角色躲避敌人攻击!谈到使用第一人称视角的原因，游戏的制作人员表示使用第一人称视角可以让玩家具有身临其境的感觉，特别是当地人向你攻击时的那种临场感。 　　除了操作有所变化，本作还加入了RPG游戏中角色成长的要素。在3DS版《生化危机：雇佣军3D》中，玩家可以调整角色的各种技能和武器，而技能和武器如何成长，在本次的报道中没有提及。 　　目前已经确认克里斯、克莱尔、克劳萨、吉尔以及第四幸存者汉克这五人将作为可操作角色登场。克里斯在游戏中的形象取自《生化危机5》，而克莱尔则是首次在佣兵模式中亮相，虽然她没有哥哥那样强的体格，不过却有着能够辅助玩家瞄准的激光瞄准镜，因此对于游戏的初学者来说，克莱尔应该是最佳选择。克劳萨和汉克因为都是出色的士兵，因此各自的实力都非常强力。克劳萨擅长使用弓箭和火箭筒，并且还配备可以近战的匕首。与克劳萨相比，汉克则在各个方面的表现都比较平均。