1.战斗方式类似实时战争游戏，直接在地图上开打（但单挑和策略会另开画面）。 　　

　　2.只能扮演君主，不能扮演其它武将。如果想要使用自己创造的新武将，也必须以君主身份出现。所以也减少很多人际关系、人才培养的指令。最多可玩八人。 　　

　　3.一年有36个回合，每回合两个阶段（战略面、进行面）。进行面时，我方武将会根据战略面所下的指令执行命令。此时完全无法变更命令。 　　

　　4.每个城市（据点）间都有固定行军路线。因此可在两城之间放置碉堡等防御设施，阻挡敌军的攻击，也可以做为我军休息处。 　　

　　5.除了10个史实剧本外，还有10个虚拟剧本，例如：超越时空限制，所有君主、武将都登场的剧本。 　　

　　6.在战斗中发动“兵法”，有可能会产生扭转局势的效果。出阵时，在武将已学得的“兵法”里选择其一，便能在战斗中使之发动。在《三国志9》，一个部队最多可以有5名武将，若能妥善利用武将的连动，“兵法”的威力将会变得更大。 　　

　　7.可以提拔小兵当武将！必须要加强版才有的功能。这是三国志9当中一个独一无二的设置，须知，许多名将都是从士兵提拔起来的，为什么平凡的小兵就无法成为武将呢？这个功能可以让你提拔被历史埋没的人才。当能力较高的武将在征战时发动兵法、营造设施之后，在换季的时候就可以提拔一名士兵充当武将。首先要替这位武将选择一名老师，经过一个季度的指导之后，这名小兵就会被提拔成武将，正式加入你的麾下！