在命运石之门0游戏中共有真有理end、红莉栖end、真帆end、bad end以及真结局五种结局，相比于改编动漫来说，游戏中的剧情细节也更加的清晰完整。

　　命运石之门0结局

　　真由理end

　　真由理和铃羽乘坐时光机回到8月21日，萌郁将头盔女杀死，冈部宣言要拯救红莉栖，头盔女真身为由季(整容后的篝)。

　　红莉栖end

　　成功消除篝脑内红莉栖的记忆，冈部到达2036年，看到了地狱和琉华死亡，经过至少3000次时空跳跃回到2010年，被铃羽打了一拳返回中二病，发送D-Rine给过去的自己，表明世界可以被欺骗，最后为了消除amadues而奋斗。

　　真帆end

　　amadues自毁，得知PC密码，amadues红莉栖拥有α世界线的记忆。

　　篝end

　　篝恢复了所有记忆，篝代替真由理和铃羽乘坐时光机回到过去。

　　在红莉栖，真帆，篝end中冈部中途回到α世界线见到了红莉栖，向FB挑明身份并与其合作。

　　bad end

　　真由理和铃羽失踪，桶子决定制作时光机，真帆被洗脑，头盔女死亡，冈部继续颓废。

　　真结局

　　labmen一行人找到了到达STEINS;GATE世界线的方法，在2025年发送视频文件给2010年的冈部，并发送D-Rine给2011年的铃羽，冈部于2025年自己死之前登上时光机。