《文明：太空》中还有一项特殊的设计就是瘴气，在佈满瘴气的位置上停留的话每回合就会损失一定的生命力，并且瘴气会阻挡商队的通行，而异族反过来则是能透过瘴气恢复生命力，只要研发特定科技就可以使用工人或是发射卫星来清除瘴气。

只要停留在瘴气之上就会损失生命力

异族反而能透过瘴气回复生命值

安排贸易路线时红色的区域就是被瘴气阻挡的位置