随着孔明的离去，赤壁大战正式打响。周瑜在柴桑城内下令，前往渡口正式与曹操决战。在城内有一个NPC会说“鲁肃大人的使命都完成了吗?”二周目时与之对话后可以去建业城宫殿找鲁肃，之后鲁肃可以永久加入我方队伍。一周目无法完成。出城在柴桑北面渡口乘坐渡船后触发赤壁剧情。赤壁攻掠战开始。

　　曹军战船分别有左翼2人、右翼3人、中部5人和本船6人，四支队伍组成。东吴军第一次派出两人(周瑜必须在队)，第二次派出三人分别需要击破左右翼曹军，完成突破之后全军汇合攻取中路(队伍恢复为七人)，最后击破曹操本船便可获得赤壁大战的胜利。

　　曹军最右侧战船处可遇一东吴士兵，与其对话后给予道具「行军帐」，然后在曹操本船的大旗下方调查两次获得道具「玉龙璧」，并完成造诣「水灵碧玉」。船上宝箱内可获得两个天赋「奋力」、「谋抗」。在金色的暴击宝箱中利用军运牌可获得「连环军印」。

　　曹军战船已经陷入火海，即使周瑜的部队行军也会受到烈火的侵蚀，失去小部分生命值。主要战斗可选择东吴的将领调配参战，周瑜虽然计策与四维还算华丽，但此间一系列战斗均需要以守为主，对方不仅肉盾比较多，而且普攻和将技伤害也很高，利用好控制型计策进行防守反击。

　　曹军战船有两翼需要突破，周瑜会提示可选择一位将军与其共同突破左翼，编所系统出现后即可选择。来到战船左翼会触发战斗，夏侯惇和曹仁出现，二人伤害很高，会施放武将计，首个回合可选择防御或者忌心控制对方，利用每回合敌军会受到烈焰伤害，防守反击，取胜不难。击败二人后左翼完成突破。在队伍中选择剩余的3名将士，前往战船右翼进行突破。右翼会遇到曹洪、乐进和弓弩手，伤害同样很高，每回合敌军依然会受到烈焰伤害，利用好防御选项，防守反击即可取胜，右翼完成突破。

　　左右两翼完成突破后周瑜大军再次集结，对曹军主船发动进攻，行至中部位置会触发战斗，贾诩荀彧等人出现阻止了周瑜进军。贾诩、荀彧会针对队伍中低智力武将施放单体计策造成巨额伤害，同时带有「离间计」控制，贾诩的武将技「漆黑」没有伤害，但会造成随机3人普攻命中完全丢失，需要格外注意。做好防守准备，周瑜的「金仙计」配合「防御」选项，其他人也可以配合恢复，每回合结束敌军会受到烈焰伤害，等敌将失去攻击力之后，即可全面反攻。

　　击败贾诩后可返回本船进行补给和战气恢复，休整完毕后可直接杀奔主船与曹操决一胜负。此战为6人BOSS战斗，曹操等人配置均衡，均有战气值释放武将技，徐晃、张辽、张郃、许褚输出很高，程昱计策伤害高，会针对智力低的武将离间，武将技伤害不高，但会降低士气，曹操有几率放武将技，徐晃开启「巨力」后基本上可直接秒杀，需要注意。曹操会根据我方的阵法针对性的布阵。

　　东吴军士气高昂战斗初始士气直接达到255点，每回合结束曹军会受到烈焰伤害，周瑜会施放「金仙计」进行全体恢复。但如果阵亡或策略值不足就不会释放了。此战有烈火助阵，利用高昂的士气尽快击杀程昱，重点关注敌将徐晃，开启「巨力」后最好要使用「忌心、离间」相互配合控制住他，防止被秒杀，许褚智力低可优先离间，避免被其击晕，失去主动权。火伤可消耗曹军的整体兵力，高昂的士气带来的巨大伤害提升可迅速击溃曹军的主要战斗力。

　　赤壁胜利后，曹操脱离战场，百万大军所剩无几，全部逃往乌林。曹操带着剩余的残军慌忙上岸，但孔明早已料到了曹操的行军路线，安排埋伏。在此遇到赵云伏兵，不敌败退。撤至葫芦口，遇到张飞埋伏，再次败退。逃向北面的华容道，遇到关羽伏兵在此，曹军众人请关羽念及旧情，放其生路，关羽不忍，最终选择放行，至此赤壁大战章节告一段落。