《分裂细胞》共有9个关卡（扩展包另有3关），每一个关卡都比较长，富有吸引力。令人失望的是，在游戏刚开始的时候就揭示了后面所有关卡的发生地点——就象是人们在欣赏一部以前从没看过的影碟时，可以利用菜单来选择播放片段——只有第一个训练关卡没有在片头出现。一般花10~15个小时的时间就可以玩完整个游戏。因为它的关卡都是按照剧本来编写的，所以重玩价值比较低。另外，游戏的难度设置中还有一项选项：“困难”。如果选择了它，秘密行动将会变得更加艰难，那些在默认设置下完成游戏的玩家可以选择它再玩一遍。令人遗憾的是，《分裂细胞》的PC版本缺少Xbox版本所附的DVD式的“制作花絮”，而且情节内容与Xbox版本一模一样，没有任何新内容。不过，据Ubi Soft称，他们将会制作一个附加的游戏关卡，Xbox版本游戏的玩家可以通过Xbox Live服务下载，PC版本也会推出类似的东西。推出更多关卡供玩家下载，这样的承诺确实让《分裂细胞》变得更具诱惑力了，最重要的是，让玩家们觉得自己掏出去的钱是值得的