与前一代相比，《网络奇兵2》除了全都是3D的画面效果外，游戏基本的介面并没有太大的改变，不过在内容方面还是有许多新意。玩家在《网络奇兵2》里所扮演的是一个经过生物机械改造的强化人，能够通过外加的零件来提升自己的能力，而属性与技能要用“升级模组”来增强，玩家在游戏中取得重大进展后就能得到一些模组，当然也有一些模组能够在各处拣到。

　　游戏的内容与属性设定可以说十分新颖，在同类游戏中并不多见。游戏中的各种属性除了玩家常见的力量、耐力及灵敏度外，还有心灵力用来决定玩者施展心灵术的成功机会和效果，以及神经机械能力一起决定玩家操作机器及侵入系统的成功机会。技能与属性关系十分密切，如有些枪可能要求玩家有三级以上的“能量武器”技能才能使用，使用它的命中率则取决于玩者的“灵敏度”属性。