『洛克人Ｘ６』的故事发生在『洛克人Ｘ５』之后， 在艾克斯(X) 与杰洛(Zero)的联手下，成功的阻止西格玛军团企图利用殖民卫星 衝撞地球的毁灭危机，不过杰洛也因此受到严重损伤。但是事情并没有这样就结束， 一种神秘的电脑病毒「ZERO」肆虐，导致 地球上的机器人集体发狂攻击人类， 而这一切似乎与艾萨克（Issac) 博士进行的「梦魔计画」(Nightmare) 有关. . .

為了阻止艾萨克博士的疯狂计画，与探查「梦魔」的真相為何，艾克斯再度展开了「洛克人Ｘ６」任务行动。

多样化的武器强化系统
- 用特殊零件强化自己，八种特殊武器, 40种强化零件！

满足玩家收藏欲望的装甲系统
猎鹰装甲(Falcom Armor)，光剑装甲(Blade Armor)与影忍装甲(Shadow Armor)提高玩家战斗力。

终极武器
- 使用超强暗黑杰洛攻打魔王！
透过隐藏路线还有隐藏被梦魔(nightmare)附身的头目！