Ubisoft表示，《孤岛惊魂3》日文版为了配合CERO分级制度的伦理规定所制定的“禁止表现”项目，因此更动了游戏内的表现，变更点包括“删除残缺尸体”、“连续杀害平民3人以上游戏就会结束”、“修正性爱场面与伤口剖面”，其余内容则是与海外版相同。修正后的分级仍为CERO最高的Z级（仅限18岁以上）。

　　官方同时公布了日文版的声优阵容以及2段日文配音角色宣传影片：

　　宣传视频1：

　　宣传视频2：

　　游戏截图欣赏：