自己下载玩了一下，发现窗口模式下无法实现1024X768的大小（某些分辨率应该也是一样）
很简单，打开“我的文档”\My Games\Ironclad Games\Sins of a Solar Empire Rebellion\Setting\rebellion.user.setting.txt（右击用记事本打开）

找到并改为：
VideoWindowedWidth 1024
VideoWindowedHeight 768

其它分辨率同理...